Já me deparei algumas vezes com essa questão.
A solução foi copiar dois arquivos do Eclipse para a pasta do PDI.
link de referência: https://diethardsteiner.github.io/pdi/2015/06/07/Fixing-PDI-GLib-CRITICAL.html
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Webmin não atualiza no Debian 8
Eventualmente a atualização deste pacote tem ficando em hang em alguns servidores. Os comandos abaixo resolveram a atualização: sudo apt-get install apt-show-versions sudo apt-get -f install
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